向陽之樹

1 序幕
安政元年（1854年）江戶時代末期的小石川，這個時代瀰漫著不安氣息。有一天，手塚良庵在花街的一個房間裡醒來，這似乎是他生活的常態。另一方面，伊武谷萬二郎繼承了父親的職位，才剛過了四個月，俸祿是15袋米，是家臣中的最低薪資。在恩師千葉周作的臨終之際，萬二郎與同學清河八郎發生衝突，並在決鬥中受了重傷。 良庵被叫去幫他治療，然而頑固的兩人又大打出手。幾天後，兩人在善正寺再次相遇。他們都愛上了寺廟住持的女兒阿石，兩人又開始吵起來。然而在歸途中，萬二郎無意間救了被陌生武士襲擊的良庵，並因為斬殺了這兩名武士而被玄武館的弟子盯上了。而為了和萬二郎做個了斷，清河八郎出現了。另一方面，良庵被當時最優秀的西醫學者・緒方洪庵收為弟子，本應前往大坂（現在的大阪）就學的良庵卻沒有去學校，而是直奔花街。在那裡他遇到了一位鬧肚子疼的妓女・十三奴，並幫她看診。良庵認為是闌尾炎，但妓院的醫生卻堅持是肚子有寄生蟲，結果十三奴不幸病死了。

2 三百坂
慶應4年（1868年）3月10日，透過勝海舟與西鄉隆盛的會談，江戶城主動投降，江戶免於戰火。另一方面，阿綾的病情正逐漸康復，良庵確認阿綾的感情後，萬二郎和阿綾便決定結婚。然而，萬二郎覺得自己作為一名武士已經落伍而煩惱不已。婚禮上，萬二郎聽說上野的彰義隊為了保護德川義信而霸佔了寬永寺，在婚禮結束後，萬二郎突然換上鎧甲出現在阿綾面前……

3 良庵起航
某一天，良庵和萬二郎在麻布的一家蕎麥麵店偶遇。兩人都是為了來見心愛的阿石，也就是善正寺住持的女兒。雖然兩人一直不對盤，但在回程中，萬二郎從不知名武士的手中救了良庵，並殺死了兩名武士。然而萬二郎卻因此被玄武館弟子盯上，而為了和萬二郎做個了斷，清河八郎出現了。

4 曾根崎新地
到達大阪後，良庵遇到了患有闌尾炎的妓女十三奴。但是身為西醫的他不能幫她治療，而來看診的中醫則是個庸醫，使良庵非常痛苦。

5 暴風雨前夕
良庵終於進入了期待已久的大阪適塾。然而被個性獨特的同學和髒亂的大通鋪嚇到，良庵天天在曾根崎新地過夜，忽視了學業。另一方面，良仙為了在江戶建立牛痘接種所而奮鬥，在府中藩的長老牽線下，獲得和大臣遠藤但馬守見面的機會，但出現的卻是反對接種的醫生們……

6 安政大地震
江戶發生了大地震，萬二郎將眾人疏散到海邊，但那裏卻是流氓的地盤。他們威脅民眾若不付錢就要殺死他們，於是萬二郎拔出了他的劍。

7 天花防治所
洪庵告訴良庵，比起接種技術，更重要的是如何讓人們接受和理解，因此禁止良庵繼續接種，但此時卻傳來了天花患者出現的消息。良庵在鎮上四處奔波以防止蔓延，但為時已晚……此時，在地震中立下大功的萬二郎見到了宰相阿部正弘，突然被問到是否希望對外國開放港口……

8 哈裡斯到來
洪庵讓良庵幫蜷屋的女兒阿品接種天花疫苗。良庵打算用自己擅長的花言巧語說服阿品，阿品卻反過來抱怨父親擅自幫她定了一個未婚夫，但她喜歡的另有其人。看著左右為難的良庵，妓女阿紺主動出手幫忙，但是……同時，一艘載著美國特使湯森・哈裡斯的黑船抵達伊豆下田外海。下田縣令・井上信濃守命令萬二郎作美國特使的保鑣……

9 噩耗與逐出師門
哈裡斯的翻譯赫斯肯告訴萬二郎，日本曾經在下田製造大砲。萬二郎向井上信濃守報告，卻反而被派去韮山，那裏有一個磚瓦砌成的巨大反射爐。萬二郎深受震撼，此時一個名叫橋本左內的男人出現在他面前，並主張應廢除幕府制度改行中央集權。這是宰相阿部正弘的計畫，萬二郎也跟著一起行動……。另一方面，阿紺來找在大阪適塾讀書的良庵，拜託良庵讓她看死刑犯的解剖……

10 神田川的決鬥
萬二郎收到父親千三郎突然去世的消息，急忙返回江戶。萬二郎得知父親是為了保護良仙而死，決定向刺客報仇。良仙和大槻俊齋為了建立接種所，拜託他將一個包裹交給阿部大人或堀田大人。

11 請願書
安政四年四月，堀田正睦、阿部正弘等人正在江戶城討論哈裡斯要求的日美通商條約。與勝麟太郎（海舟）一起來到江戶的萬二郎，被質問哈裡斯的真實意圖，但他卻高燒而意識不清，反而不停講著無關的牛痘接種所。另一方面，收到萬二郎帶來的請願書的財政大臣川路聖謨，被幕府的醫官多紀誠齊賄賂。同時，曾在安政大地震中被萬二郎幫助過的阿品，從大阪來探望他。

12 拜見將軍
安政四年，美國特使哈裡斯即將來拜見幕府將軍家定。然而，天生身體虛弱的家定連話都說不出來。宰相便召集醫官，命令他們務必在一個月內治好家康。其中一位醫官偷偷來請教西醫伊東玄朴。玄朴和良仙認為這是西醫界千載難逢的機會，於是找來良庵和萬二郎一起商量方案，他們能成功嗎……

13 醫官
與哈裡斯的會面圓滿結束，良庵鬆了口氣，卻又被伊東玄朴緊急叫出去。玄朴說，雖然家定被診斷是睡眠不足，但醫官之一的多紀元迫卻抱有疑問，並私下向他諮詢。良庵前往大阪，夙夜匪懈地調查緒方洪庵的藏書。最後洪庵給了良庵一本全是英文的醫學書。 為了翻譯，良庵將書帶回江戶，並請求萬二郎讓他見赫斯肯。

14 接種所創立
安政五年，堀田正睦失勢，伊井直弼成為宰相。身為堀田部下的萬二郎也被解僱，不再擔任哈裡斯的保鏢。此時，幕府將軍家定突然病情危急，伊東玄朴也作為醫官被召到江戶城。突然被任命為醫官，玄朴難掩喜悅。良仙知道後，請玄朴親手把接種所的企畫書交給宰相。玄朴雖然答應會盡力而為，但是……

15 虎列剌蔓延
安政五年的初夏，良庵在接種所裡精力充沛地工作著。當時有傳言說長崎有7000人死於虎列剌（即霍亂），疫情甚至要從九州蔓延到本州和江戶。而阿紺也染上了霍亂，良庵聞訊趕到她身邊，但她已經處於昏迷狀態，良庵能拯救她嗎？與此同時，良庵的母親阿中也染病，良庵陷入兩難！

16 入獄
安政五年七月，江戶的霍亂疫情終於穩定下來，而在堀田正睦倒台後繼任宰相的井伊直弼開始鎮壓以水戶藩為中心的一橋派，史稱「安政大獄」。萬二郎也被羅織罪名，因為與西鄉吉之助（隆盛）、橋本左內等人密談推翻幕府而遭到逮捕。而且，萬二郎被視作離開府中藩的脫藩武士。良庵無法理解，並設法救出遭嚴刑拷打的萬二郎，但是……

17 春天的風暴
幕府對攘夷派的鎮壓越演越烈，在良庵的計謀下假死脫身的萬二郎，前去水戶藩的長老安島帶刀，告訴他江戶的情況。在那裡，萬二郎結識了高橋多一郎等尊王派的志士。他們如何看待想要重建幕府的萬二郎？另一方面，江戶神田發生了火災，接種所也不幸被燒毀了。需要大量重建資金的良庵前去拜訪在新港橫濱開店的阿紺，並請她介紹能籌集到資金的顧客，卻被捲入了事件中……

18 回家
萬延元年夏天，安政大獄結束後，詐死躲藏在水戶的萬二郎被勝麟太郎（海舟）召回了江戶，請他繼續以幕府家臣的身分擔任哈裡斯的保鑣。萬二郎大吃一驚，立即前往善福寺，但卻遭到丑久保陶兵衛等刺客襲擊。萬二郎追著陶兵衛來到他家，卻發現……。另一方面，良仙中風倒下了，而前來看診的俊齋告訴良庵一件事……

19 惜別
文久二年春天，勝麟太郎（海舟）為了與外國平起平坐，於十二月起開始徵兵。在此之前，他請萬二郎先將農民訓練成陸軍的重裝步兵。萬二郎為了訓練農民傷透腦筋……。另一方面，善正寺的阿石出家為尼，良仙也病危，萬二郎與良庵的周遭漸漸發生轉變……

20 訪客
文久二年八月，在尊皇攘夷運動愈演愈烈之際，緒方洪庵離開大阪適塾，以西醫研究所所長兼醫官的身份來到江戶。良庵正要去見洪庵時，自稱水戶藩憂國之士的浪人們卻找上門看診。因為他們傷得太重，良庵只能向其他醫生求助，但他們卻阻止他通知別人，良庵能救下他們嗎？另一方面，萬二郎率領農民組成了步兵團，卻有幾名農民想加入清河八郎建立的浪士組織（後來的新選組）……

21 軍營醫師
文久三年春天，隨著步兵隊成立，幕府開始尋找駐守在軍營的軍醫。洪庵向政府推薦了良庵，但良庵卻躲在阿紺的豐屋，遲遲不肯答覆。此時，阿紺想要承辦建造步兵隊營地的木材採購工作，卻被多摩屋的第二代老闆成吉刁難。成吉威脅阿紺，要在投標時暴露她當過妓女的事。 良庵想幫助阿紺，但是……

22 步兵團上陣
文久三年十一月，浪人們以攘夷和救濟貧民為藉口結黨作亂。在九十九里地區，真忠組像強盜一樣為非作歹。於是萬二郎率領步兵團，奉命討伐真忠組。然而，步兵們得知第一次的對手不是外國人，而是同樣來自農民階級的真忠組時，他們退縮了。而成為軍醫的良庵也和他們一起上了前線……。另一方面，因為步兵營的木材採購而對阿紺懷恨在心的多摩屋成吉，找上了陶兵衛……

23 黎明的突襲
真忠組・楠音次郎的妹妹阿綾出現在步兵團面前，目的是為了調查幕府軍的動向。而萬二郎決定在黎明時出擊。聽見指揮官萬二郎的吆喝，士兵們儘管害怕還是奮力衝鋒。萬二郎也與刺殺了父親千三郎的音次郎正面交鋒，他有機會贏嗎？

24 長州遠征
元治元年夏天，萬二郎和步兵們正在苦練，真忠組・楠音次郎的阿綾卻突然出現並當場暈倒。雖然她在江戶的法院被嚴刑拷打，差點失去理智，還是留著一口氣來為哥哥報仇。儘管她是有殺父之仇的音次郎的妹妹，萬二郎還是收留了阿綾。另一方面，幕府正準備討伐與朝廷為敵而被趕出京都的長州藩，萬二郎也隨著步兵團離開江戶，前往大阪。在那裡萬二郎結識了坂本龍馬。坂本說德川幕府已經沒救了，他要建立一個新的國家……

25 正面談判
慶應二年，幕府軍陷入與長州藩的苦戰。軍醫良庵看著源源不斷的傷兵感到沮喪。萬二郎向勝海舟提議重建幕府，而勝海舟卻在思考如何結束幕府。之後，薩摩藩背叛幕府，與長州藩結盟，最終幕府還權於朝廷。另一方面，在萬二郎的照料下，阿綾恢復了意識，但萬二郎做出了一個決定，離開了阿綾……